Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms