Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LCN9Q8WX39 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms