Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms