Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APCDD1LQ8NCL9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCDD1LQ8NCL9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms