Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GDPD1Q8N9F7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms