Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ARHGEF39Q8N4T4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ARHGEF39Q8N4T4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARHGEF39Q8N4T4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARHGEF39Q8N4T4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARHGEF39Q8N4T4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ARHGEF39Q8N4T4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ARHGEF39Q8N4T4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ARHGEF39Q8N4T4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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ARHGEF39Q8N4T4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARHGEF39Q8N4T4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARHGEF39Q8N4T4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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