Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms