Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C9orf135Q5VTT2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf135Q5VTT2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf135Q5VTT2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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