Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC153Q494R4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC153Q494R4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms