Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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HIST2H2BEQ16778 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIST2H2BEQ16778 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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