Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TCEA2Q15560 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TCEA2Q15560 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TCEA2Q15560 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TCEA2Q15560 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms