Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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BRD3Q15059 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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BRD3Q15059 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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BRD3Q15059 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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BRD3Q15059 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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BRD3Q15059 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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BRD3Q15059 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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BRD3Q15059 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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