Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOFQ13790 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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APOFQ13790 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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APOFQ13790 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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APOFQ13790 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOFQ13790 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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