Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE3BQ13370 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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