Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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