Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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