Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC15Q0P6D6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms