Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms