Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RPS3AP61247 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms