Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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TMEM258P61165 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TMEM258P61165 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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