Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN15P56746 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN15P56746 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms