Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTTPP55157 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTTPP55157 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTTPP55157 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTTPP55157 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTTPP55157 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTTPP55157 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTTPP55157 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms