Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms