Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSR4P51571 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSR4P51571 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms