Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms