Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ME1P48163 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ME1P48163 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms