Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms