Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7BP35670 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7BP35670 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms