Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
JAK1P23458 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JAK1P23458 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JAK1P23458 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JAK1P23458 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JAK1P23458 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms