Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms