Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms