Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms