Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC175P0C221 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC175P0C221 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms