Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSLP07711 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSLP07711 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSLP07711 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSLP07711 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms