Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHEP01854 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHEP01854 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHEP01854 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHEP01854 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHEP01854 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHEP01854 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHEP01854 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IGHEP01854 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGHEP01854 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHEP01854 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms