Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD2O96028 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD2O96028 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSD2O96028 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms