Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms