Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms