Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SGSM2O43147 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SGSM2O43147 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms