Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CLDN25C9JDP6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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