Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL13PA6NNM8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms