Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms