Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM35Q9UPQ4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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