Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms