Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms