Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms