Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSHZ2Q9NRE2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms