Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms