Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf50Q9BV19 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms