Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MESP1Q9BRJ9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms